L’antibiogramme : interprétation, pièges et nouveautés

L’évolution rapide de la résistance aux antibiotiques, en particulier chez les bactéries à Gram négatif, nécessite des outils fiables pour guider l’antibiothérapie. La détermination de la sensibilité aux antibiotiques est donc une activité centrale des laboratoires de microbiologie clinique. Le but est d’assurer l’adéquation entre le traitement antibiotique et la sensibilité des isolats bactériens, de détecter les résistances acquises, et de fournir des données pour le suivi de l’épidémiologie de la résistance aux antimicrobiens. De nombreuses méthodes d’antibiogramme sont disponibles : microdilution en milieu liquide, méthode automatisées, diffusion en milieu gélosé. Toutes ces techniques offrent des résultats qualitatifs :  catégorisation des isolats bactériens en sensible, intermédiaire ou résistant et certaines des résultats quantitatifs (concentration minimale inhibitrice). De plus, l’antibiogramme est un outil essentiel pour la détection de mécanismes de résistance émergents, malgré les progrès de la génomique. Si de nombreux outils permettant la détection rapide des mécanismes de résistance sont aujourd’hui disponibles, il est probable que l’antibiogramme gardera une place importante dans la prise en charge des infections bactériennes dans les prochaines années. Son interprétation, parfois complexe, impose un dialogue entre le microbiologiste et le clinicien.

The rapid evolution of antimicrobial resistance, in particular among Gram-negative bacteria requires accurate identification of resistance mechanisms in order to guide antibiotic therapy. Hence, determination of antimicrobial susceptibility of relevant bacterial isolates is a major task of clinical microbiology laboratories. The goal is to confirm susceptibility to selected antimicrobial agents, to detect resistance, but also to provide data for empiric antibiotic therapy guidelines. Various methods are available to perform antibiograms: broth microdilution, automated methods and manual methods such as disk diffusion. All methods provide qualitative assessment using the clinical categories susceptible, intermediate or resistant and some methods can provide qualitative result (minimal inhibitory concentrations). Additionally, antibiogram is a useful tool to track changes in antimicrobial resistance, as mechanisms are too diverse to be easily detected by current molecular techniques. While rapid techniques and new automated methods that could provide faster results are under development, it seems likely that antibiogram will continue to be relevant for the years to come in the management of bacterial infections. Its appropriate interpretation, sometimes complex, underline the constant need of dialog between microbiologists and clinicians.